Санаторий «Магистральный» имеет общетерапевтический профиль. Проводится лечение пациентов с заболеваниями органов дыхания, костно-мышечной системы и соединительной ткани, периферической нервной системы, органов пищеварения, системы кровообращения.
Лечебный массаж, лечебная физкультура, галотерапия, грязелечение сапропелевыми и иловыми грязями, фитотерапия, ароматерапия, лечебная сауна, физиотерапия: электросветолечение, высокочастотная физиотерапия, низкочастотная физиотерапия, светолечение, лазеротерапия, теплолечение, бальнеотерапия, рефлексотерапия, тракционная терапия сухая, тракционная терапия подводная, бассейн, гидротерапия кишечника.
В лечении заболеваний органов пищеварения, почек и обмена веществ используются бутилированные хлоридо-кальцево-натриевые минеральные воды малой минерализации (2.5 – 3дм3)
В санатории «Магистральный» работают водолечебница (лечебные ванны, души, подводное вертикальное вытяжение позвоночника), кабинет сухих углекислых ванн «Reabox», кабинет рефлексотерапии (иглоукалывание, теплопунктура, микроволновая резонансная терапия, гирудотерапия,фармакопунктура) высокочастотной и низкочастотной физиотерапии, светолечения, лазеротерапии, теплолечения, ингаляторий, кабинет ароматерапии, фитобар, ручного и аппаратного массажа, сухого вытяжения позвоночника на системе «детензор», гидротерапии кишечника, ЛФК, 2 бассейна с гидромассажами и каскадами, процедурный, стоматологический кабинеты, грязелечебница (5 кушеток с иловыми и сапропелевыми грязями).